Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Abcf3Q8K268 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Abcf3Q8K268 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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