Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FgbQ8K0E8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms