Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA2

Amt, Aminomethyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmtQ8CFA2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
AmtQ8CFA2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms