Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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