Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg4aQ8C9S8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Atg4aQ8C9S8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms