Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms