Protein–RNA interactions for Protein: Q8C735

Lin9, Protein lin-9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin9Q8C735 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lin9Q8C735 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms