Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc113Q8C5T8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms