Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cnot2Q8C5L3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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