Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TtpaQ8BWP5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TtpaQ8BWP5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms