Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdca8Q8BHX3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdca8Q8BHX3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms