Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cyp4f39Q8BGU0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms