Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms