Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

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Length 1,240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NfascQ810U3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms