Protein–RNA interactions for Protein: Q810Q5

Nmes1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmes1Q810Q5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Nmes1Q810Q5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms