Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Smim19Q80ZU4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Smim19Q80ZU4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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