Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Npm2Q80W85 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Npm2Q80W85 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Npm2Q80W85 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Npm2Q80W85 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Npm2Q80W85 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Npm2Q80W85 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms