Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pnma8aQ80VM8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms