Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccp110Q7TSH4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms