Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smap2Q7TN29 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms