Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmed3Q78IS1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms