Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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Ccdc88cQ6VGS5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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