Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SvoplQ6PDF3 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms