Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trak1Q6PD31 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms