Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zbtb40Q6PCS8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms