Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smarca2Q6DIC0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smarca2Q6DIC0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms