Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PnkdQ69ZP3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms