Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sh3rf1Q69ZI1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sh3rf1Q69ZI1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sh3rf1Q69ZI1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sh3rf1Q69ZI1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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