Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Pkp4Q68FH0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pkp4Q68FH0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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