Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top2bQ64511 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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