Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa17Q64016 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms