Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrhQ62361 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrhQ62361 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms