Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mrc1Q61830 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrc1Q61830 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms