Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r1bQ60829 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms