Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Samhd1Q60710 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Samhd1Q60710 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms