Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms