Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Spire1Q52KF3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spire1Q52KF3 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms