Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
C2cd3Q52KB6 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms