Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc27a5Q4LDG0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms