Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc3lQ4KL14 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms