Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmub2Q3V209 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmub2Q3V209 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmub2Q3V209 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Tmub2Q3V209 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmub2Q3V209 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmub2Q3V209 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms