Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ckap2Q3V1H1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms