Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Smim9Q3V0X1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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