Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn4Q3UWL8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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