Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
D130052B06RikQ3UW13 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms