Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Znf48Q3US17 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Znf48Q3US17 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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