Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SbsponQ3UPR9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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