Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edc4Q3UJB9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms