Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rnf224Q3UIW8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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