Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrrc58Q3UGP9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lrrc58Q3UGP9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrc58Q3UGP9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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